GLOSSARY

توالی‌یابی 16S rRNA (16S rRNA Sequencing) معمولاً توالی‌یابی ژن نشانگر ریبوزومی برای ترکیب باکتری و برخی آرکی‌هاست؛ با خواندن همه ژنوم یا همه ویروس‌ها فرق دارد.

مثلاً نتیجه نمونه پس از سفر یا تغییر رژیم را با سابقه همان روزها می‌خوانیم؛ تفاوت با هم‌تیمی یا یک درصد برجسته، به‌تنهایی هدف مکمل یا نشانه افت آمادگی نیست.

زمان جمع‌آوری، نگهداری، استخراج، آلودگی و پایگاه مرجع بر گزارش میکروبی اثر دارند. نمونه مدفوع پس از تغییر دارو، بیماری یا سفر باید با همین سابقه خوانده شود. نبود شناسایی به معنی نبود قطعی جاندار نیست و حضور توالی هم همیشه زنده‌بودن را ثابت نمی‌کند. برای مقایسه فردی، روش ثابت و سؤال مشخص لازم‌اند؛ دو گزارش از آزمایشگاه متفاوت الزاماً مانند دو وزن‌کشی قابل‌جایگزینی نیستند.

توالی‌یابی نشانگر ریبوزومی معمول برای بررسی باکتری و برخی آرکی‌ها با توجه به آغازگر و روش به کار می‌رود؛ پوشش کامل ویروس و قارچ را فرض نمی‌کنیم. شات‌گان مجموعه گسترده‌تری از DNA نمونه را می‌خواند و می‌تواند اطلاعات عملکردی بیشتری بدهد، اما به عمق و مرجع وابسته است. هیچ روش صرفاً با نامش تشخیص بیماری یا نسخه شخصی غذا نمی‌سازد؛ محدودیت تفکیک گونه و سویه نیز باید روشن باشد.